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测序得到基因序列后如何分析呢 都需要用什么软件啊 新手 拜托高

归档日期:07-07       文本归类:多态性      文章编辑:爱尚语录

  测序得到基因序列后一般都需要进行序列比对,看和目的序列的差异情况,常用的软件有DNAman,还有invitrogen的vectorVI也不错。此外还可以直接在网上进行比对,推荐NCBI网站的BLAST可以直接网上进行。

  不用担心,多熟悉几遍就可以操作了,很简单的,要对自己有信心,加油!追问谢谢,还想问下blast中比对数据库应如何选择啊 我做的是mrna反转录cdna后转入大肠杆菌测序,那我比对时是不是得选取reference rna sequence 还是选什么核苷酸库,都不懂呢,麻烦您了追答你需要预先知道你的目的序列,例如mir-145反转录后的序列(可以用primer5来得到序列的反转录序列)然后和你测序得到的序列进行比对。对mir-145(一般为人的miRNA)从NCBI的序列库里查找就好了。

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